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Microb Cell Fact | 遵义医科大学冯昆团队揭示无柄灵芝培养物产生灵芝酸的机制

发布时间：2024-07-25

三萜类化合物已表现出广泛性的微生物生物，属于抗癌肿和抗病力毒用途。通畅，三萜是使用甲羟戊酸渠道获得的，并从天然动植物动植物和念珠菌中分离出来。遵义医科大学冯昆团队在Microb Cell Fact（IF=6.4）上发稿了发表文章“Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile”的探讨开题报告。该探讨表明三萜类有机物灵芝粉粉酸（GA）是使用液状体培養的无柄灵芝粉粉菌丝体中二萜15,16-二氢丹参酮I（DHT）的怪物转换制造的。确认转录组和淀粉酶质组学技木进那步探讨无柄野生野生灵芝菌丝体中DHT制造四种野生野生灵芝酸（GA）的机制化，并通过几组学技木验测到的性别距离基因遗传和性别距离淀粉酶，估测DHT 怪物人工 GA 的路线。拜谱生物提供了转录组测序和TMT定量蛋白质组学技术，为研究二萜生物转化为三萜提供了丰富的组学信息和候选基因。

文章名称：Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile（Microb Cell Fact，IF=6.4，2023.7）

客户单位：遵义医科大学

研究材料：无柄灵芝真菌菌丝体

拜谱提供技术：转录组测序、TMT定量蛋白质组学

研究结果

1.转录多组分析和职能类别

用对无柄灵芝粉真菌感染菌丝体去转录组测序共能够得到67230个转录本和14296个单遗传染色体。在这个单遗传染色体中，492被检测为地域差异表现遗传染色体（DEGs），至少213个表现调涨，279个表现上涨（图1A）。GO含有分享后，DEGs为菌物步骤中（BP）、人体细胞系营养成分（CC）和碳原子能力（MF）3类。在BP门类中，出来了前4个子门类：四环素拆分新陈分解排泄步骤中，乙酸盐新陈分解排泄步骤中和甲酸盐新陈分解排泄步骤中 ;而在CC门类中，人体细胞系外区、突触复合型体、突触构造是前4个亚类。谈谈MF门类，甲酸脱氢酶（NAD）活力性、氧化物重现酶活力性和酸氨（或酰胺）连入酶活力性是前4个亚门类（图1B）。在DEGs的KEGG通道分享中，前30条含有度最低的通道中含27条类属新陈分解排泄，至少甲烷气体新陈分解排泄、乙醛酸盐和二羧酸盐新陈分解排泄、丙酸盐新陈分解排泄手机信号通道取得含有（图1D）。

图1|转录类物质析和职能总类

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

2. 蛋白质组定量分析和功能分类

实现对无柄灵芝粉病菌菌丝体来球球氨基酸组学参数了解，大概选定了16,457种多样肽、2606种球球氨基酸和2588种定量了解球球氨基酸。在阈值法|FC|>1.2和p<0.05的筛分水平下，在这儿2606种球球氨基酸中，94种被鉴定费为地域性别差异表达方式爱球球氨基酸（DEPs），各举52种上涨，42种下降（图2A），图2C凸显了地域性别差异表达方式爱球球氨基酸的聚类了解法参数了解热图。从GO参数了解一起来看，BP分类凸显，绝大部分数DEPs参与到乙酸盐吸附上皮受损体细胞系消化吸收方式、抗菌素吸附吸附上皮受损体细胞系消化吸收方式和类药吸附吸附上皮受损体细胞系消化吸收方式。CC类DEPs在上皮受损体细胞系外区、过氮化合物物酶体和微体中增长率比较高，氮化合物替换酶活力和甲酸脱氢酶（NAD）活力在MF类中DEPs的比例表比较高（图2B）。与转录组最后同类，KEGG信息信号通路参数了解凸显，许许多多DEPs在吸附上皮受损体细胞系消化吸收中生物技术技术含有，各举3条最生物技术技术含有的条件是光合生物技术技术中的碳固产品定地方、碳吸附上皮受损体细胞系消化吸收和MAPK信息信息信号通路（图2D）。于此，实现参数了解GO参数库的CC对DEPs来亚上皮受损体细胞系产品定位参数了解和引用（图2E），DEPs通常分布点在上皮受损体细胞系质（40.66%）、上皮受损体细胞系膜（17.58%）、线粒体（12.09%）和内质网（8.79%），方法论上是GAs生物技术技术炼制的通常地方。

图2|血清质组的参考值研究和效果检验

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

3.转录组和蛋白质组数据相关性分析，RT-qPCR验证

过活物流量转化和相较比较组待选DEGs和DEPs定制了维恩图，有20个一定的差异展现染色体（图3A）。对转录组和球营养素组中E组和C组共设的DEGs/DEPs实现聚类阐述阐述，显示mRNA和球营养素区间内有16个上浮染色体和6个变动染色体，DEGs及其译文资料的DEPs展现的水平呈正各种重要性，源于Pearson的各种重要性弹性系数阐述，在转录组和球营养素组区间内检查测量到相对应较高的各种重要性性（R = 0.87）（图3C）。实时荧光定量PCR（RT-qPCR）监测的数据信息，E组和C组13个DEGs的展示标准异同特殊，当中9个为调整DEGs，1个为调整DEGs（图3D）。DEGs在RT-qPCR中的展示潮流与转录类物质析的但是一直。

图3|核脂肪酸组的定量研究分析研究分析和功能模块证实

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

拜谱小结

综上所述，该研究结果为真菌对天然产物的生物转化提供了新的见解，这将有助于开发更有效、更经济的方法，以方便的方式获得稀有的三萜。拜谱生物提供了转录组测序、TMT定量蛋白质组学转录组学技术，拜谱生物可提供完善成熟的转录组学、蛋白组学、代谢组学以及多组学联合产品技术服务体系。此外，拜谱生物推出的中药代谢组整体解决方案，基于更丰富、更专业的中药数据库，更高的数据质量、更优质的服务，可进行中药成分分析、中药入血/组织分析、网络药理学等分析，助力客户探索中药前言研究，欢迎致电咨询！

参考文献：Wang X, Wu H, Wong KH, Wang Y, Chen B, Feng K. Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile. Microb Cell Fact. 2023 Jul 28;22(1):139. doi: 10.1186/s12934-023-02156-5.

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