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项目文章(Cancer Letters IF:10.1)|从糖代谢到表观遗传:肝癌进展的隐藏引擎

发布时间:2025-11-21
带来重程序设计是恶性肺部良性肿瘤發生和新进展的象征,匍萄糖带来的改变了起着本质用途。种转移使恶性肺部良性肿瘤良性肿瘤体细胞才能快捷添加能量消耗并带来必不可少的带来中间商体,进而不支持增强学习产生。也许有着重点价值,但恶性肺部良性肿瘤良性肿瘤体细胞调涨糖酵解的逻辑仍不是理解。

近日,上海医科一本大学一附带大医院王学浩院土精英团队在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,球蛋白互作组和靶向疗法激光能量分解代谢检测分析服务。

英文音标大标题:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)

2英文副标题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路

加盟商公司:南京医科大学

分析村料:细胞

拜谱展示服务于:转录组测序+淀粉酶互作组+靶向药物能力新陈代谢组

枝术自驾路线:

深入分析结杲

01、YBX1被鉴定结论为HCC中糖酵解的关键所在基因遗传

本探讨抓取HCC恶性淋巴肺部淋巴肿瘤子样本(n=7)的单生殖受损癌细胞RNA测序资料集开展介绍,看见糖酵解亲水性主要是集中在在恶性淋巴肺部淋巴肿瘤生殖受损癌细胞中,hdWGCNA介绍自动识别出9个DNA模块图片(图1A-G)。TCGA-LIHC列队的极限我的世界生存介绍知道YBX1为自主极限我的世界生存危险影响因素(图1H)。进一个步骤联系IHC、WB进行实验和恶性淋巴肺部淋巴肿瘤组建开展与毗邻非恶性淋巴肺部淋巴肿瘤组建开展的环境空间转录组学资料集证明YBX1是肝生殖受损癌细胞癌控制的不确定靶点(图1I-K)。

图1:YBX1被制定为改善HCC细胞核糖酵解的重要各种因素

02、YBX1有利于HCC中的有氧糖酵解和分裂繁殖

为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向疗法人体脂肪排泄组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。

图2:YBX1促进会HCC中的有氧糖酵解和增值能力

03、OGT与YBX1结合在一起并有利于促进YBX1的O-GlcNAc糖基化

为了识别YBX1的调控因子,球蛋白互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。

图3:OGT与YBX1紧密联系并驱动YBX1的O-GlcNAc糖基化

04、YBX1的O-GlcNAc糖基化开展其磷酸性反应,得以推进其核转位

进那步查重YBX1的O-GlcNAc糖基化要不要危害其磷酸性反应,在OGT敲低的HCC细胞系膜中或用OGT减缓剂OSMI-1加工加工处理,YBX1蛋清平均关卡有效有效降低,YBX1磷酸性反应有效减掉(图4A-C)。IP实验设计凸显,在雷同的Flag-YBX1底物平均关卡下,YBX1-WT的磷酸性反应平均关卡有效优于YBX1-T57A,是会因为磷酸性反应的新增往往仅是会因为更为重要的YBX1蛋清展示(图4D)。分离加工处理了核和质多组分察觉TMG加工加工处理的HCC细胞系膜中YBX1核展示的身高(图4E-F),进那步察觉YBX1磷酸性反应的主要调指数公式是AKT(图4G-I)。这个察觉认为O-GlcNAc糖基化用带动其磷酸性反应来加强YBX1蛋清动态平衡性并带动核转位。

图 4.YBX1的 O-GlcNAc 表达有益于其进步发现磷酸性反应表达并都可以催进其核转位

05、YBX1利于PKM2转录

前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。

图 5.YBX1带动PKM2转录

06、YBX1 并能增加组核蛋白乳过酸淡化水平方向

探索会发现YBX1敲低差异性拉低血清酶质乳过酸,更是是H3K18乳过酸(图6A-C)。糖酵解减弱剂2-DG的研究验证了糖酵解与组血清酶乳过酸的简单绑定,减弱糖酵解可差异性拉低H3K18la的水平(图6D)。PKM2过展现可逆性转YBX1敲低造成的H3K18la越来越低,到外源乳酸正确处理不禁增加H3K18la,还引发YBX1展现调涨,提示卡的存在正方向调查问卷(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR验证,H3K18la借助丰度于YBX1启动时子简单催进其转录,该历程受O-GlcNAc糖基化调节作用(图6H-J),并会发现P300 调涨是YBX1增进H3K18乳酰化做用的策略(图6K-L)。

图6.YBX1提高H3K18乳过酸淡化总体水平

新闻稿件工作小结

在各种探究中了解了YBX1在HCC中高表现,并与糖酵解迷切关联。YBX1在T57处被O-GlcNAc绘制,可以安稳淀粉酶质并延长其表现。各种绘制还使得YBX1在T57处的磷硝化作用,使得其核易位。之所以,哪一时不断增强了糖酵解关联表观遗传的转录并刺激到乳酸的行成。与此同时,YBX1启用P300的转录,接着驱程组淀粉酶的乳硝化作用,尤其是是H3K18la,H3K18乳硝化作用同向改善YBX1表观遗传转录(图7)。

图7.Y糖酵解-表观遗传性双面馈环系统图

拜谱总结ppt

本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱生物体为该研究提供了转录组测序,蛋白酶互作组和靶向疗法能量转换基础代谢组技术服务,拜谱生物工程建立了完善成熟的转录组学、蛋白酶组学、翻意后突显组学、产生组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!

参考使用医学文献

Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.
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