
2024年9月由沈阳林果业高中张万刚硕士生导师人员在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱生物工程为该研究提供了亚硝基化表达组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
中文字幕小标题:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
学术期刊:Journal of Agricultural and Food Chemistry
202多年影响到细胞:5.7
发过时段:2024年9月
消费者机关单位:南京农业大学
研究探讨素材:蛋白
拜谱提供了技术水平:亚硝基化修饰组学
技术工艺路径:
一、分析結果
01.Caspase-3亲水性
近些年尚不明了NO对caspase-3的促使用会不会归因于NO介导的S-亚硝基化,不同的密度梯度方向的GSNO最为外源性NO供货,以诱骗caspase-3的休外S-亚硝基化。成果认为,与沒有GSNO的组相对比,100、200和400μM GSNO组的caspase-3活力明显减轻(图1),与仍然新闻报导高度。GSNO处理减轻caspase-3活力的意向的原因仍亟需系统阐述。
图1 各种不同溶度的GSNO工作对caspase-3渗透性的会影响
02.Caspase-3的S-亚硝基化层面
理论调查Caspase-3的亚硝基化因素,以阐释GSNO对Caspase-3的反应迟钝性。经GSNO加工处理后,检侧到caspase-3核蛋白S-亚硝基化效果多(图2)。那些效果取决于,外源性GSNO陪养可成就 帮助caspase-3的身体S-亚硝基化。另人惊叹的是,在都没有GSNO会有的比较组中检侧到一位忽闪的S-亚硝基化带,这取决于caspase-3几率引发内源性的S-亚硝基化。不但,本理论调查中caspase-3的S-亚硝基化因素较高,而caspase-3的抗逆性有效降低,这与已经的理论调查相符。那么,caspase-3的特异形S-亚硝基化体现位点尚不很明白,还需用进一歩的打磨。
图2 GSNO操作对caspase-3S-亚硝基化技术水平的影响到
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化淡化组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的编码字段。暗蓝色标上的编码字段说S-亚硝基化肽,紫色标上的C说S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱仪
04.S-亚硝基化Caspase-3分解结蛋白酶
结球蛋清为是一种极为非常重要的人体组织细胞骨架球蛋清,在维系肌人体组织细胞格局设计的格局设计完成性和收敛性部分起着极为非常重要做用,调查S-亚硝基化caspase-3对结球蛋清分解的铭感性和理性有极为非常重要有何意义。与Std(未用胱天球蛋清酶-3和GSNO孵育的缺省肌食物仟维球蛋清)组比起来,0 μM GSNO组(肌原食物仟维和caspase-3的孵育,无GSNO)的完成结球蛋清成分可观大大减少,提升caspase-3对结球蛋清有暗藏的球蛋清水解反应专业能力。在GSNO孵育后,完成结球蛋清的成分明显的增添(P < 0.05)。不仅如此,当GSNO盐浓度提升时,完成结球蛋清的成分不间断上浮(P < 0.05)(图5)。这些出现 揭示,SNO遮盖的caspase-3以含量根据的行为促使结球蛋清的分解。
图5.S-亚硝基化caspase-3化学降解结蛋白酶
05.S-亚硝基化Caspase- 3分解肌钙血清-T
肌钙核蛋清质酶-T (TnT)是原肌球核蛋清质酶自动调结全权负责相关肌肉收缩毛孔的细细的的须要肌原钎维核蛋清质酶。TnT的生物光生物挥发结构特征是监测到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化前提下,caspase-3对TnT的生物光生物挥发问题如图图示6图示,与Std组(中含caspase-3和GSNO的肌原钎维)相信,caspase-3组中30 kDa TnT细节描写文化差异性增大,反映caspase-3参与性了TnT的生物光生物挥发,与此同时,caspase-3与GSNO的孵育最终得以造成30 kDa TnT减低。在100和200 μM GSNO组左右不监测到凸显的文化差异(P > 0.05),而当GSNO的氨水浓度可达到400 μM 时,该细节描写文化差异性减掉(P < 0.05)。这样的感觉反映了SNO体现的caspase-3对TnT生物光生物挥发的抑加工用使用。结核蛋清质酶和TnT是caspase-3的太敏感底物,而GSNO进行处理降低了caspase-3的活力也许最终得以造成肌原钎维核蛋清质酶生物光生物挥发状态降低了。指出指出,NO成脂的S-亚硝基化也可以确认体现半胱氨酸残基来自动调结caspase-3的活力,以求进步应响其对结核蛋清质酶和TnT的核蛋清质酶溶解业务能力,最终得以应响牛羊肉品行。
图6. S-亚硝基化caspase- 3降解塑料肌钙蛋白质-T
二、总结
本探索重在一起探讨S-亚硝基化对caspase-3修饰语语的影晌简述很快对羊肉片肌原弹性纤维材料体内分解的影晌。淀粉酶S-亚硝基化会修饰语语caspase-3的半胱氨酸残基,得以促使caspase-3渗透性变低,进一点可抑制了其对羊肉片肌原弹性纤维材料淀粉酶的淀粉酶油脂水解工作能力。三、拜谱个人总结
论述探讨运用了酶活检验,亚硝基化突显组学分享,WB等查重技术手段,看到淀粉酶酶S-亚硝基化可突显caspase-3的半胱氨酸残基,这导致了caspase-3活性酶类的变低,齐头并进一点压制了其对牛羊肉肌原纤维棉淀粉酶酶的淀粉酶酶油脂水解能力素质。本论述探讨为解释一下淀粉酶酶质亚硝基化对吃起来的政策调控机制化作为一堆个新的第一人称。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的球胆固醇组学、掩盖球胆固醇组学、分泌组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸全系列设备,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺过酸、total硫化还原系统、悬浮巯基,欢迎大家咨询!
参考价值论文毕业论文:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663