
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱生物学 为其提供 TMT淀粉酶组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
研究分析成果
分析人工探索发生变化食品冷藏箱用时延后时间间隔羊肉的硬性标准、持来说水力、红颜色、被氧化钙分子量铁分子量、ROS、脂质过被化合物、MDA、GSH和GPX4平行来风险评估背部肌肉组织机构生殖癌细胞的铁死掉状况。然而表示,食品冷藏箱用时延后时间间隔后,羊肉的硬性标准在第5天和第6天强势走低;持水工作能力降底;红颜色变深,没有光滑,鲜灰色就来为暗灰色。凡此种种,被氧化钙分子量铁、生物氧和MDA的分子量强势延长,生殖癌细胞凋亡率强势变高。 学习人群领取区别保鲜时的肌肤合格品的淀粉酶质,以后做SDS-PAGE分享一下,淀粉酶质条带在区别时代分布点更加均匀且类同(图1a)。依据淀粉酶在区别合格品中的表达爱情況,分享一下出现 不同组合格品的中个数靠近于不同质量(图1b),原因分析肌肤合格品淀粉酶质具备稳定的组内类同性和组间区别性。 氨基酸质组学共亲子认定出1996种氨基酸质。以B0为参考组,建立B1、B2、B4和B6中的氨基酸做对比表答具体分享,共亲子认定到376个DEPs。将火山图可视化效果,并利用FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05两位标准化具体分享DEP。导致右图1c-f随时,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分发型别亲子认定出22、33、73和140个DEPs,里面分发型别上浮6、11、32和8七个,变动16、22、41和58个。聚类算法方式方法分析了有所不同冷藏箱第一阶段肌肤组织结构中氨基酸质的表答,导致展示肌肤氨基酸表答对比随着时的推移店铺时的多而多(图1g)。
图1| 与众不同冷冻的时间的肌原辅料蛋清质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 有文化差异 要在冷藏室保存时间间隔的力量样品管理文化差异蛋白质分析一下(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁死亡视频淀粉酶肽的PRM酶联免疫法浅析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 根据KEGG聚集差距描述核蛋白的铁身故措施(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱工作小结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生物技术提供了TMT降钙素原检测核蛋白酶质含量组学技术设备工艺贴心服务培训,拜谱生物制品已科研搞定并开发了落实旺盛期的转录组学、核蛋白酶组学、代谢率组学包括几组学聯合產品技术设备工艺贴心服务培训体系建设,欢迎致电咨询!
基准论文文献综述:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.